почему базаров был обречен на погибель?

Если дословно воспринимать вопрос, то он, будучи медиком, подцепил смертельную заразу, по-моему корь, и от нее в мучениях скончался.
Еже ли в плане задумок Тургенева, то, я считаю, что он погиб, как образ непризнанного, не нашедшего места в той жизни, человека. Это мое личное мнение. Я могу ошибаться, так как читал очень давно.

слишком рано появился не в ладах с самим собой Вроде добр- а после себя оставляет цинизм и развалины

такова была воля автора

Именно, что обречён. Читала давно, но школьную трактовку смысла пересмотрела недавно. Думаю, по той же причине, по которой погиб Башлачёв в своё время, и многие... многие. Потому, что Базаров прежде всего был мыслящим человеком. А таким людям рано или поздно, но всегда становятся тесны рамки предлагаемых обстоятельств, и непременно, однажды для них теряют силу прежние авторитеты. Да и груб, и нигилист и всё такое, но всё это не от отсутствия любви, а от её избытка в нём. Он пытался прорваться сквозь эти рамки, но не мог. Ему было скучно жить, но при этом, он хотел жизни, он хотел работы и был полон любви к жизни. И момент смерти всё объясняет. Ведь автор умертвил Базарова именно таким способом. Герой умер из-за заражения при порезе пальца в процессе работы над трупом тифозного мужика, который, как предвестник, был привезён ещё живым, но уже умирающим в дом к Базаровым. Я вижу в порезе символ прорыва, который стал возможным только таким способом. Он сам перед смертью говорит: любовь-форма, а раньше, в начале приезда к родителям, Базаров цитирует крестьянских мальчишек, поющих "новые" песни: "время верное приходит, сердце чувствует любовь". Я думаю, этим он нашёл ответ и примирение с собой. Он сам был той формой, через которую пыталась прорваться любовь, в самом широком смысле этого слова, которую он чувствовал в себе, но не мог выразить. И так же вижу символ условного примирения "Отцов"и "Детей" в совместной практике отца и сына перед смертью Базарова. Так я думаю теперь.