В Опере в меню выберите пункт Справка - > О программе.. . Там и будет на странице написан путь в директории с кэшем, по умолчанию: /home/ИМЯ_УЧЕТНОЙ_ЗАПИСИ/.opera/cache/
Чтобы эту скрытую папку было видно в Nautilus, нажмите в нем Ctrl+H или в меню обозревателя файлов выберите Вид -> Отображать скрытые файлы
я точно не знаю, но по логике вещей он должен быть в
~/.opera
где ~ замещает путь к Вашей домашней папке.
папка /.opera естественно скрытая (об этом нам говорит точка перед ее названием) . так что название папки надо руками вбивать в nautilus'е или в терминале:
cd ~/.opera ls rm -rf ~/.opera/*
последняя команда удаляет содержимое папки /.opera