Free Video Converter. Конвертирует любые видео файлы. К сожалению последние его версии стали частично платными. Могу выслать старую полностью бесплатную. Или скачай здесь.
http://www.koyotesoft.com/indexEn.html Но некоторые функции там обрезаны. Может как раз те, которые тебе нужны