XP стоит на активном разделе(3-й по счету), а все равно бутится с первого неактивного. Почему так может быть?

а ты файлик boot.ini проверял? записи в них (это перенаправитель для загрузчика) указывают, на каком разделе стоит загружаемая по умолчанию и остальные ОСы. открыть его можно "пуск - выполнить" и ввести "C:\boot.ini". Вот пример, как он может выглядеть:

[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /noexecute=optin /fastdetect
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional RU" /noexecute=optin /fastdetect

у меня их две, при загрузке выводится спиок с возможностью выбора. По умолчанию та, которая в первой строчке после [operating systems]. При этом, как видишь, указание пути на операционку выглядит НЕ как простой путь (символическая ссылка) а как жесткая ссылка с указанием физического жесткого диска (шина, устройство, раздел.... его номера: 0,1 и т. д.) , потом только номер логического раздела на жестком диске. Сконфигурировать его можно вручную, если знаешь, как составить жесткую ссылку на нужный раздел, или загрузиться в режиме консоли при установке винды и выполнить команду bootcfg /rebuild