что значит автономия университетов?

Скорее всего это когда они живут своей жизнью, как некие маленькие городки: )
Примером может служить университет из фильма "Код да Винчи" :)

По замыслу реформаторов: университет сам зарабатывает деньги для своего существования, предлагая разного рода образовательные услуги за плату, сдавая в аренду свои помещения.... да мало ли. Остаётся немного так называемых бюджетных мест, обучение на которых оплачивается государством, стипендия студентам. За это ВУЗ должен следовать общим правилам приёма, а не предлагать своих.... и т. п. всё долго писать

автономия это без телефонов ,