чем отличается межрайонная налоговая от обычной

Берёт больше.

Помоему совершенно ничем.

У инспекций имеются нормативы по количеству обслуживаемых налогоплательщиков.
Межрайонная инспекция создается в 2 случаях
1) В крупном городе, когда единая городская инспекция не сможет справится, в этом случае отдельные районы города обслуживаются одной "межрайонной инспекцией например ленинского и Октябрьского районов города Y-ска"
2) В районных центрах региона, когда нагрузка по налогоплательщикам одного района слишком маленькая и создают одну инспекцию на несколько соседних районов, тогда это "Межрайонная инспекция Ивановского, Петровского и Сидоровского районов W-ской области"

По выполняемым функциям они равнозначны