почему пишется шЁпот гаварится же шОпот (шопотом)? какие ещё похожие случаи есть )

Потому что звуки Ш, Ж, Ц были когда-то мягкими (это явление можно наблюдать в современном болгарском языке) , а потом они отвердели, а написание гласных после них таким и осталось. Поэтому мы имеем такое правило, оно называется "традиционное написание". Далеко не всё в русском языке пишется так, как слышится. Почму Вы не спрашиваете по поводу слов МОРОЗ, например, КОРОВА и т. п. Тут такое же явление.