Прежде всего давно существует и развивается Krusader (ему, в общем-то всё равно, что он порождение KDE, он где угодно живёт, в т. ч. под GNOME). К тому же как всегда в соотношении KDE/Windows давно не просто "аналог" Total Commander, а намного круче по функционалу и настраиваемости:
Ну и попытка GTK+ (помоложе и покривее) его воспроизвести - Gnome Commander:
Оба в репозиториях основных дистрибутивов с GNOME. Даже У*бунты.