На флешке обнаружены повреждённые ячейки памяти. Можно ли их восстановить, и какой программой лучше это сделать?

Можно, используя программы для восстановления компьютерных данных и самих флешек:
- ChipGenius v2.72 (2009-02-25) - утилита для получения информации о всех подключенных USB устройствах. Показывает значения VID&PID. Есть встроенная база по которой определяется модель и производитель контроллера.
- CheckUDisk v5.0 - утилита для получения информации о всех подключенных USB устройств. Показывает значения idVendor и idProduct для определения типа контроллера устройства. А также показывает скорость, ревизию, серийный номер флэш накопителя.
- UsbIDCheck (USB Bench - Faraday USB Test Utility) - программа для получения информации о всех подключенных USB устройств. Показывает значения idVendor и idProduct для определения типа контроллера устройства. Список, по которому можно определить производителя устройства – файл usb.ids.txt в папке программы.
- Flash Disk Utility v1.20 - программа для быстрого и полного форматирования флешки, создания загрузочного диска, сжатия даннных и шифрования паролем, инструкция на английском языке.
- FlashNull - утилита по проверки работоспособности и обслуживанию Flash-памяти (USB-Flash, IDE-Flash, SecureDigital, MMC,MemoryStick, SmartMedia, XD, CompactFlash и т. д.) . Список выполняемых операций: - Тест чтения - проверка доступности каждого сектора носителя (дублирует функциональность обычных HDD-тестов) - Тест записи - проверка возможности записи каждого сектора носителя (дублирует функциональность большинства HDD-тестов) - Тест сохранности записанной информации - проверка соответствия записанной и прочитанной информации (аналогично функциональности memtest, но в отношении flash-накопителей) . -Сохранение образа содержимого устройства - посекторное сохранение всего (или части) содержимого в файл. (аналогично функциональности dd из UNIX). - Загрузка образа в устройство - посекторная запись образа в устройство (аналогично функциональности dd из UNIX). Инструкция на русском языке.
iCreate_iFormat_V1.32 - утилита для контроллеров iCreate i5122, i5128, i5129. После установки программы рабочее окно появляется и пропадает, вставив флешку можно форматировать.. .
- MPTool V2.0 (MXT6208+A MPTool V2.0) - утилита для восстановления флешек на контроллере MXTronics MXT6208A. Помогают китайским флешкам Kingstone и некоторым Sony подделкам. - UmpTool v1.6.3 - утилита для восстановления флэш на контроллерах Chipsbank CBM2090. Возможно подойдёт для других контроллерах серии CBM209Х.
- USB Disk Storage (HP USB Disk Storage Format Tool v2.1.8) - утилита для форматирования и создания загрузочного USB Flash (поддерживается NTFS, FAT, FAT32). - Dr. UFD v1.0.2.17 (PQI Dr.UniFlashDisk 1.0.2.17) - фирменная утилита для низкоуровневого форматирования флэш на контроллерах PQI. Поддерживаемые модели: - Card Drive Series - Intelligent Drive Series - Cool Drive Series - Traveling Disk Series. - EzRecover - утилита восстановления USB Flash, помогает, когда флэш определяется как Security Deviсe, вообще не определяется или показывает 0Mb объем. Для того чтобы EzRecovery увидел флэшку надо после запуска программы и выдачи сообщение об ошибке вынуть флешку и снова вставить ее и тогда все путем. Внимание! После использования программы все данные на флэш не сохранятся.
- FORMAT v30112 - фирменная утилита для флешек PQI. Позволяет форматировать, управлять разделами, создавать скрытые и запароленные разделы.
- JetFlash RecoveryTool v1.0.5 - утилита для восстановления (ремонта) USB Flash Transcend. © http://www.flashboot.ru

Стандартными средствами ОС восстановить невозможно, хуть и пишит, что мол восстановление битых секторов, но результат - затирает их и помечает как bad.
Попробуйте hdd regenerator - меня не раз выручала.

Программа HDD Regenerator делает загрузочную флешку и из загрузочного режима (до загрузки операционной системы) тестирует сектора жестких дисков и флешек. видит ошибки там где другие программы не находят! на жестких дисках может перемагнитить повреждённые сектора! очень рекомендую, умная программа! Но на флешке восстановить испорченный сектор не сможет, это деффект микросхемы, заводской брак скорее всего!