При реорганизации путем присоединения вышестоящей организации в каком случае закрываются счета?

Кто присоединяется, у того и счета закрываются. Остается только один расчетный счет.

не совсем понятен вопрос, НО
счета организация сама закрывает по мере необходимости (переход в другой банк, банкротство, нет необходимости в использовании и пр.) ,
а в случае реорганизации, т. е. продолжает существовать, но под другим названием, другой управляющей компанией и пр. -
СЧЕТ ОСТАЕТСЯ ДЕЙСТВУЮЩИМ, но документы об изменениях необходимо представить в банк как можно быстрее.