Да, да, и ещё раз - да и только да!
И Чабрец, и Тимьян - это синонимы, а именно - русскоязычное название рода Thymus из семейства Яснотковые (они же Губоцветные) , которое на латыни Lamiaceae или Labiatae соответственно.
НЕТ в природе видов просто "тимьян" и просто "чабрец".
Всегда есть двойное название - Род и вид - Тимьян ползучий (и в синонимах пишут - он же Чабрец ползучий) Thymus serpyllum L.
В простонародье самые распространённые виды рода всегда называют только родовым названием, например наш "одуванчик" - он одуванчик лекарственный Taraxacum officinale Wigg., "подорожник" чаще всего оказывается видом Подорожник большой Plantago major L., "чистотел" - видом Чистотел большой Chelidonium majus L., и так далее.
Но с точки зрения ботаники это абсолютно неверно, точнее - неточно, поскольку нельзя подменять название конкретного вида общим названием рода.
В каждом из этих родов растений много разных видов.
Зайдите на профессиональный ботанический сайт Плантариум - вот страничка с перечнем видов из рода Тимьян (чабрец) :
http://www.plantarium.ru/page/taxonomy/taxon/43973.html Сколько насчитали?.. Вот то-то и оно!
А вот их изображения:
http://www.plantarium.ru/page/view/item/43973.html Разумеется, любой вид Тимьяна (Чабреца) - он всё равно Тимьян (Чабрец) , но какой именно? - просто слова "тимьян" "чабрец" не дают определения вида, это - лишь род.