Не ходят большие пакеты > 1469 байт, с командой xconnect при соединении Cisco 3750 ME и Cisco ROUTER 7304

Поищи настройки MTU. Может, вобще длинные кадры не поддерживает? В этом случае часть кадра будет отбираться на служебные заголовки влана.