Подскажите в чем причина, когда смотрю в объектив там мутно, после съемки фото четкие. Фотоаппарат D 90?

При съемке смотрят в ОКУЛЯР.
Протрите окуляр

А зачем смотреть в обьектив? смотрите в окуляр (видоискатель). .
У вас со зрением все в порядке?

Там есть колёсико, которым можно настроить. У меня оно с правой стороны от окуляра,
сверху. Смотрите в окуляр и крутите колёсико, пока не станет нормально.

настройка диоптрии, те под зрение, в инструкции есть, рядом с окуляром колесико

Фокусировка автоматическая, можно и не глядя в объектив снимать, на чем нибудь резкость да наведется.
А резкость в окуляре уже в соответствии со своим зрением регулируешь, поэтому резкость в окуляре и резкость на фото никак между собой не связаны.
Если будешь в ручном режиме на резкость наводить, "тады ой", резкости снимка не будет

....а колёсико это не влияет на качество фото, потому, что регулирует лишь сам видоискатель.