Можно ли на одном хостинге в одном аккаунте завести домен, а в другом поддомен?

зависит от вашего хостинга впрочем в какой-то мере.
Домен вы можете размещать на любых DNS серверах не зависимо от хостинга вообще. После сделать соответствующие DNS записи на адреса хостинг компаний и на любой аккаунт прекрепить любой домен или даже на один аккаунт. При условии что хостинг позволяет Вам это сделать, все серьезные, платные хостинги как правило позволяют это.
Тоесть например домен site.ru вы можете настроить на один аккаунт хостинга, домен poddomen.site.ru можете направить на другой аккаунт. А можете вообще на другой хостинг.