будет ли работать быстрее модем в USB 3.0 чем в 2.0

значительно если он сам тоже 3

Смею предположить, что есенин ошибается.
Скорость юсб модема зависит не от юсб в который он сунут.
поколение юсб говорит лишь о скорости обмена данными непосредственно с девайсом, на скорость же обмена данных девайса с вышкой ( ну если 3G ) оно никак не повлияет.
может быть имеет смысл ставить юсб3.0 для юсбишных же вайфай модулей, ну а в целом такая хитрая операция ни к чему не приведет.

Зависит от скорости модема может ему и 2.0 хватит но вообще будет

для начала - не плохо бы знать что что USB 2 и USB 3 отличаются не только названием.
Они имеют разные посадочные гнезда.
т. е. Вы не сможете вставить обычную флэшку в порт USB 3
Естественно и модем тоже не подойдет.
Так что вопрос решается сам собой.
Работать будет быстрее все то что сможете вставить в USB 3

порты USB 2.0 и USB 3.0 отличаются только цветом, посадочные гнезда совместимы USB 1.0 USB 2.0 USB 3.0.

Не путайте разницу между usb1 и usb2. Кроме цвета usb2 отличается от usb3 скоростью передачи данных. И достигается это на за счет цвета, а за счет пяти дополнительных контактов у usb3, которые находятся, так сказать, на дне разъема. Если вставляем флеш или модем Usb2 в разъем usb3, он будет работать как usb2, не быстрее, но, вставится без проблем, так как разъем идентичный, а лишние контакты usb3 просто будут не задействованы, и порт usb3 будет работать в режиме usb2

Зависит от скорости интернета) Отличие USB 3.0 и USB 2.0 — скорость передачи данных. Скорость USB 2.0 — 480 Мбит/с, а USB 3.0 — до 10 раз быстрее, 4,8 Гбит/с.
Модемы обычно ограничены 150 Мбит/с, соответственно в таком случае разницы нет.