Никаких сложностей нет, все что необходимо - написано на сайте посольства
http://mzv.cz/http://www.mzv.cz/Moscow Бронируете отель, покупаете билет и в посольство, только делайте все заранее, а не впритык.
Если боитесь что визу не дадут, то бронируйте отель на Booking (там есть варианты с бесплатной отменой бронирования) . за гостиницу Вы в любом случае всегда платите по приезду. Тоже самое можно сделать и с билетами (есть варианты возврата)