При проверке почты с пом Микрософт Аутлук 07 все письма сохраняются только в эту программу. В инт эксплорере пусто!

Интернет эксплорер это БРАУЗЕР
а Аутлук - почтовый КЛИЕНТ
учите матчасть

А галочка "Оставлять копии сообщений на сервере" (Сервис-Настройка учетных записей - Изменить - Другие настройки - Дополнительно) стоит?