Что такое дефрагментация диска? Если дефрагментировать диск, изменятся ли настройки диска?

Если дефрагментировать диск, настройки диска НЕ изменятся.
бесплатные дефрагментаторы (гораздо лучше штатного виндозного) :
1. элементарная в обращении, Disk Defrag -
http://genealogic.narod.ru/soft/computer/disk-defrag.htm
2. чуть больше настроек, Defraggler -
http://genealogic.narod.ru/soft/computer/defraggler.htm
3. более крутая, JkDefrag -
http://genealogic.narod.ru/soft/computer/jkdefrag.htm

На любой ОСи есть встроенный дефрагментатор, правой кнопкой на диске, свойства, сервис, но есть и сторонние дефрагментаторы, посмотрите в интернете, их много

Пуск--Справка и поддержка--Дефрагментация. . лучше не производить сторонними программами, а той, что в Пуск--Служебные (потом будут проблемы)
Хорошая прога для устранения ошибок реестра:
http://www.softportal.com/software-7460-vit-registry-fix.html Vit Registry Fiх (б/пл)
http://www.vitsoft.org.ua/ его офиц. сайт (бесплатная ссылка справа внизу стр.)

Дефрагментация диска-операция по перемещению информации с разрозненных кластеров в монолитное поле с начала диска с высвобождением дискового пространства для дальнейших записей. Убыстряет работу винчестера. После дефрагментации в FAT таблице прописываются новые адреса для перемещённой информации. Настройки диска не требуется.