годен ли в армию с гидроцефалией

Это не гидроцефалия, а гидроцефальный синдром. Там зависит от цифр в обследованиях, посмотрите, какие обследования на руках. Обычно внизу каждого пишут процентное отношение к норме кровотока и подписи: умеренно нарушен,
умеренно снижен, в пределах нормы, значительно повышен и т. п. ,собственно на основании этого и делает врач выводы.
Что делать, если сомневаетесь? пройти альтернативное обследование за деньги в уважаемом в вашем городе учреждении. Взять с ссобой маму-папу, грамотную тётю (лучше врача) с собой в военкомат, акты и обследования с собой и доказывать, что негоден. И, кстати, будете обследоваться сразу делайте копии и на подпись и мокрую печать к главврачу. Копии держите дома.