Почему полет из Москвы до Владивостока занимает 9ч, а из Владивостока до Москвы 11ч? есть этому объяснение?

Разница есть, но она, как правило, не такая большая.

Вот, например, вчера рейс Трансаэро вылетел из Домодедово в 19:37, прибыл во Владивосток в 3:13. В пути 7 часов 36 минут. Вчера же рейс этой же компании вылетел из Владивостока в 6:01, прибыл в Домодедово в 14:21. В пути 8 часов 20 минут.

Объясняется это преобладанием западных ветров по трассе маршрута Москва - Владивосток - вспоминайте школьный учебник географии (т. н. западный перенос) . Во Владик самолёт летит с попутным ветром, в Москву - против ветра. Вот разница и набирается.

Не исключено, что в отдельных случаях разница может достигать и двух часов. Самолёт Москва - Владивосток - это не поезд, который шпарит по Трассибу и других вариантов не будет. М. б. , например, так: на восток самолёт летел при нормальной погоде, а на обратном пути повстречалось ему что-нибудь типа грозового фронта, который он вынужден огибать, тем самым удлиняя маршрут и увеличивая время полёта. Но это скорее исключение.