Есть ли разница дневника 1-4 классов и 5-11? Не считая обложки

Есть. Но не существенная.

Дневники для начальной школы отличаются более крупными буквами.
Да и количество предметов в начальной школе не такое уж большое, как в старших классах - не восемь уроков ежедневно, а четыре-пять.
Также вряд ли понадобятся в младших классах формулы по алгебре, физике или химии, которыми нередко пестрят современные дневники.
А что касается внешнего вида дневников для маленьких учеников, то тут границ фантазии дизайнеров нет.
Дневники старших классов и объёмнее, и насыщеннее.