Забавно, действительно поискав понял, что основная масса в этом направлении - либо наворочанные монстры с кучей ненужных функций либо ущербные поделки с уродским интерфейсом. Ну и много народа еще за это и бабок хочет...
единственно что б-м соотвествует - Free Stopwatch Portable.
http://free-stopwatch.com/ бесплатно, портативно (установка не нужна) , запускается нужное ко-во, в опциях поверх окон есть, достаточно компактен
да. еще - портативка качается по этой ссылке на странице - остальное - установщики.