подскажите что нужно делать если у 2х летнего ребенка кариес

Все правильно и микробы, и недостаток элементов.
Понятное дело это не просто и само не пройдет. Да, молочные зубы выпадут, но проблема то не в зубах. Зубы просто являются индикатором проблемы, которая находится внутри.
Зубы выпадут но внутренняя проблема останется и чем раньше вы поймете, что здоровьем надо заниматься целенаправленно, постоянно и осознанно, тем быстрее и надежнее будет результат.
Определитесь для себя, что вы желаете получить.
Вы можете переложить ответственность на стоматолога, и закрашивать краской (серебром) проблему, и при этом говорить вот мне же так сказали, что я могу сделать.
Есть второй вариант, более сложный, но результативный.
Вы берете на себя ответственность за здоровье ребенка и досканально во всем разбираетесь. Потратите какое то время, чтобы понять причины болезней, особенности детского организма, способы поддержания здоровья и прочее.
Информации такой достаточно, она в понятной доступной форме.
Если решите идти по второму варианту обращайтесь, я смогу вам помочь.