Выдали французскую долгосрочную студенческую визу, но вместо Etats Schengen написано France (sauf CTOM). Что это значит?

Это значит, что у тебя национальная виза Франции, дающая право на пребывание исключительно в этой стране

Это значит, что тебе выдали французскую визу, а не шенгенскую.
Каждая страна, входящая в шенгенское соглашение, имеет право выдавать и свои национальные визы.
Первоначально въехать, скажем, в Германию по ней не удастся.

Моя дочь училась в Париже. Одна из ее подруг, имея такую же визу, решила на выходные съездить в Германию. Случайно немцы на границе проверили документы (вообще, они часто проверяют машины едущие из Голландии) .
Провела несколько часов в полиции и отделеалась предупреждением о депортации в случае повтора и телегой в университет.
Эта виза дается только для пребывания во Франции, так что о путешествиях по Европе не думайте.

Национальные визы, которые оформляют консульства стран, входящих в Шенген, дают право на ПРЕБЫВАНИЕ только в одной стране и ТРАНЗИТ через другие страны (естественно, не любые) . Понятно, что из Франции в Россию через Португалию не ездят. А вот через Германию и Польшу - ездят.
Поэтому можно купить билеты с пересадками по Кельну, Берлину и Варшаве. Главное, чтобы в каждой стране находиться не более 2 суток.
Если на границе или в самом Берлине полиция устроит проверку, им показываются эти билеты и никаких претензий не будет.

Взъезжала по такой визе во Францию через Финляндию. Проблем не было. После валидации визы, можно путешествовать по всей зоне шенгена и Швейцарии