Как выехать С Киева в Эстонию с польской визой? Как правильно мне это сделать?

Какие проблемы? Если нет прямого автобуса из Киева, до Таллинна, то через Минск поезжайте. Деньги, документы, страховка- и вперёд.

можно автобусом, например автобусе ECOLINES
туча самолётов
если напрягает пользование польским шенгеном-то через варшаву