Как оформить визу в Японию, если живёшь в регионе? Надо ли ехать в Москву, или есть надёжные компании, работающие удалённо?

Особенность оформления японсокй визы в том, что для нее недостаточно брони в отеле. Нужно именно приглашение от человека, живущего в Японии (наряду с другими документами)
Турфирмы сотрудничают с такими людьми (что-то приплачивают им, видимо)
А в каком регионе-то? Поузнавайте. Наберите в поиске: "Оформление визы в Японию в... (Урюпинске, Алапаевске, Березниках,...)
Уж в областном (краевом) центре всяко должны быть такие услуги