Могут ли при при диагностики авто выявляться оштбки, а на бортовом компьютере их нет

Запросто, все эти бортовые компы не идеальные приборы, могут и не считывать данные с ЭБУ. Тем более, что желательна полная диагностика, а не одна считка кодов, сами коды ошибок не показывают на 100% неисправность, нужно их проверять.

Да, могут

смотря какой машин и какой сканер

Они есть на борткомпе, только на твоей панели они не отображаются.
Скажем так: на водительской панели борткомп отображает не все ошибки, а самые важные. Так понятно?

Да может, мех. поломки никак не диагностируются. Но иногда они скрытые. Симптомы и поведение авто в студию! Дело в том, что одна казалось бы незначительная не диагностируемая ошибка, может потянуть довольно значительные затраты из кармана. Нужна полная проверка и не кустарным китайским сканером, а заводским диагностическим центром у официалов. Этим грешат все американские машины, особенно Форд.