С помощью какой программы можно сохранять Flash-баннеры?

открой html код страницы... и найди там прямой адрес проигрываемого банера... далее скачай любой программой для скачиваний.. .
обычное расширение - swf

пример - r1.mail.ru/b5072009.swf

Типа открываешь типа исходник страницы, типа ищешь URL баннера и типа скачиваешь типа по этому типа URL. Не забудь типа порадоваться после типа этого типа.