если с загранпаспортом доехать до Калининграда, можно ли там быстро оформить визу в Клайпеду?

а быстро - это для вас сколько?

я разрешаю

Быстро, это сколько

Скажите пожалуйста, почему нельзя оформить визу в Клайпеду заранее, и ехать в Калининград и потом в Клайпеду уже с визой?
Т. е. задолго до поездки, т. е. в Вашем городе. Вам ведь придется оформлять визу и себе и детям.

Виза оформляется по месту регистрации

Визовый центр Литвы в Нижнем Новгороде вроде как на Щербакова, 15, по другим данным - на Ошарской, 16.
Туда и обращайтесь.

Документы:
https://ru.mfa.lt/ru/ru/turizm-prochie-chastnjye-posesheniaa

1. Перед поездкой Вы оформляете Визу шенгенскую, то есть любой страны, но так как Вы едете в Литву, то и Визу лучше делать литовскую.
2. Для этого можно действовать 2 вариантами: а). самим подать ДОКУМЕНТЫ в литовское консульство ( Москва, Питер) б). Оформить визу через ВИЗОВЫЙ центр в вашем городе - САМЫЙ УДОБНЫЙ . Там вам объяснят, как ие документы надо, сколько это стоит и т. д.
3. Затем выбрать более удобный транспортный способ . Если вы едете на поезде, то очень удобно ...Выход из транзитного поезда в Вильнюсе

В связи с тем, что билет на поезд из Москвы до Вильнюса стоит в полтора-два раза дороже, чем билет из Москвы до Нестерова (первой станции Калининградской области), многие пассажиры покупают билеты именно до этой станции, а по факту выходят раньше - в Вильнюсе (билет до Вильнюса исчисляется по международному тарифу, а до Калининграда - по российскому).
Ну а так конечно самолет из Москвы, до Вильнюса или до Клайпеды