Сначала обрезаем нужный фрагмент в видео-дорожке на шкале времени, в котором нужно провести треккинг.
Выделяем этот фрагмент щелчком левой кнопки мыши.
Жмём Alt+X
Жмём "Начать отслеживание".
Ну, или почитайте тут:
Отслеживание движения | Руководство Filmora для Windows