Что делать РТГ, если на маршруте школьник отказывается из-за усталости посещать один из музеев. Какой акт составляется?

Никакой акт составлять не надо. Сами решайте - оставлять его в гостинице и с кем, либо везите в музей - пусть сидит в входа и группу ждет.

Во-первых, следует предупредить до начала поездки, что программа обязательна для всех. (Откажется один, тут же еще десяток присоединится: "Ему можно, а нам нельзя?" - в результате в музей не пойдет никто)
Во-вторых, если экскурсия оплачена, и акт Вам нужен для отчета перед родителями, то денег никто возвращать не будет, и об этом тоже следует предупреждать заранее. Можно позвонить родителям, проинформировать. Можете в свободной форме (для себя, в общем-то) написать бумажку об отказе (юридической силы не имеет)
В-третьих, если ребенок категорически не хочет (добавляем еще парочку таких же), оставлять детей без присмотра нельзя, то есть один из руководителей развлекает, занимает отказавшихся, а второй идет с детьми на экскурсию.
А вообще... Программа заранее обсуждалась? Все согласились? (и родители тоже?) Значит, программа обязательна для всех.