Пришло письмо с налоговой, о том, что в суд направлено заявление о вынесении судебного приказа, что делать, и сроки

Ждать когда суд выдаст судебный приказ, получить его, а за тем подать заявление о его отмене.
Если налоговая выставила несправедливые и незаконные требования, то сейчас можете подать жалобу прокурору, в которой можете требовать как приятия мер для устранения допущенных нарушений закона, так и увольнение нерадивого чиновника ИФНС, как не исполнившего ст. 18 Конституции РФ. А Вам в помощь статьи 2, 3, 45, 52 Конституции РФ и статьи 26-29 закона "О Прокуратуре РФ".