Перед тем, как учить сам JS лучше ли будет ознакомиться с Jquery, если мне нужно для написания сайтов?

jQuery - это библиотека для JS. Т. е. это нечто вспомогательное. Можно программировать на JS без jQuery, но нельзя программировать на jQuery без JS.

Если вы изначально собирались писать при помощи библиотеки jQuery, то можете начать именно на нём, т. к. вам просто не понадобится понимание работы JavaScript(у них разная логика построения, да и в принципе, думать придётся по разному).

Если же вы собираетесь писать на JavaScript, вам стоит ознакомиться с имитацией jQuery:
document.querySelector();
document.querySelectorAll();
element.querySelector();
element.querySelectorAll();

Честно говоря я не знаю, будет ли вам нужна библиотека, для того, чтобы пользоваться ими, т. к. сам пишу преимущественно на jQuery.