НАТИВНЫЙ Значение: (от лат. nativus - врожденный) То есть то значение, которое разработчики рассматривали в качестве основного. Да, как правило, лучшие характеристики у матрицы именно на этом значении.
Как отмечает sergeynikolaevich (см. https://yandex.ru/znatoki/question/computers/kakoe_nativnoe_iso_u_nikon_d7200_795641eb/): "Нативное iso - это то, на котором матрица работает нативно, то есть без обработки, родное iso. Для максимального качества лучше снимать на нативных значениях ISO для конкретной модели фотоаппарата. Нативное ISO может являться наименьшим среди списка доступных значений, а может и нет".
По данным DxOMark нативное ISO конкретно для модели Nikon D3300 - 100. Для интереса отмечу, что, скажем, для Nikon D5100 - тоже 100, для D5000 - 178, для Nikon D810 - 63.
не стоит замарачиваться поиском нативного ИСО, ибо его никто не знает. Вообще ИСО пришло из пленочного времени: dpreview.com/articles/8924544559/you-probably-don-t-know-what-iso-means-and-that-s-a-problem