Кто может фактически принять наследство?

не важно, кто с кем проживал, от места проживания порядок наследования никак не зависит. если нет завещания, то наследуют по закону . первая очередь - дети, родители, супруг. если нет наследников перовой очереди, то идут наследники второй очереди - родные братья, сестры, дедушки, бабушки, далее третья очередь - тёти и дяди. и т. д. (четвертая, пятая, шестая, седьмая очередь). в общем, было бы наследство, а какая-нибудь родня, желающая его получить, как правило, находится.

А каким образом они будут принимать наследство фактически? Срок принятия уже пропустили?

Если наследники первой и второй очереди отсутствуют или не захотели принимать наследство, то может и тётка, как наследник третьей очереди, и более дальние. А двоюродные братья -- если их родитель-наследник умер раньше наследодателя. Они сами по себе не наследники, только по праву представления. Фактическое принятие нужно доказывать. Тем, кто официально проживал вместе с наследодателем, это сделать проще, достаточно справки о регистрации. А остальным нужно будет доказать, что они начали пользоваться каким-либо имуществом умершего, ремонтировать его, оплачивать счета и т. п.