Подскажите, пожалуйста, что делать с яблоней?

я не биолог и подсказать не смогу
но мои родители собирали высокие яблоки с помощью палки на конце которой обрезанная на половину бутылка

Дистанционно точного ответа Вы не получите. Но, в принципе, вопрос в грамотном формировании кроны дерева. В общем, яблоки могут вырасти на тех ветках, которые будут иметь максимальное количество солнечного света. Возможно, густая крона сверху притеняет нижние. Может быть, она именно слишком густая. Посоветую полистать литературу по формированию кроны плодовых деревьев, наугад ничего вырезать не нужно, т.к. дереву может стать таки больно, эти дела делаются не за раз, а в течение нескольких лет. Но опять же, это только мои теоретические построения- конкретное дерево нужно видеть, спасибо.

Надо было пригибать ветки, пока молодые. Теперь перепривейте на низкое, а это спилите.

если нижние ветки не старые и гибкие , на будущий год весной растяните их на распорках , чтобы привыкали к горизонтальному состоянию. только без фанатизма , чтобы не сломались . это необходимо так как яблоня дает урожай на горизонтальных ветках

А новые ветки где появились? Они же еще молодые и поэтому на них нет яблок. А вообще плоды у яблонь появляются на горизонтальных ветках.

формировать дерево отгибать ветки приобрести стремянку и плодосьемник.