Есть ли в "Мастере и Маргарите" положительные герои?

Положительные герои в "Мастере и Маргарите", разумеется, есть. Это Иешуа Га-Ноцри, Мастер и Маргарита.
Многочисленные претензии ряда читателей к моральным качествам героев, вынесенных в заглавие, можно обращать к автору, но он задумал именно так. Вам не нравятся эти герои, вы считаете их недостойными нести столь почетное звание? - это ваши проблемы. Многим вообще весь роман не нравится. На здоровье.
Никому не приходит в голову оспаривать тот факт, что, скажем, Стародум и Правдин - положительные образы, а Митрофан - отрицательный. При этом непредвзятое сегодняшнее прочтение пьесы вполне позволяет сказать, что несчастный недоросль - единственный живой образ, желающий вполне нормальных человеческих радостей и восстающий против сухой совершенно не нужной ему псевдоучености, которого злые дядьки именно за эти его человеческие желания отправляют в солдаты (напомню, в те времена это практически пожизненно). Но умный читатель поймет условия эпохи и не будет возражать, что по конструкции произведения восемнадцатого века расклад положительных и отрицательных героев в пьесе именно такой, как я написал.
То же и с романом Булгакова. У него положительные герои - трое названных мной. А кто как к ним относится - совсем другой вопрос.