Можно ли замачивать корни орхидеи сначала в марганце, а потом в фитоспорине перед пересадкой?

Можно, но есть более эффективная комбинация средств. Замочить в растворе Максима, через день, два после посадки полить раствором Алирина.

для чего все это ?

Если были повреждены корни гнилью или инфекцией, тогда замачивать нужно. Если же ничего этого нет, то не стоит растение пичкать, может быть негативная реакция растения.