В Clickhouse есть поля foreign_key, many_to_many, one_to_many т.д. Могу ли я использовать эту базу в проекте на django?

Для того, чтобы работать с БД, совсем не обязательно использовать ORM. Так что ты можешь использовать любые СУБД, для которых имеются Python-библиотеки. Для ClickHouse существуют сторонние библиотеки: https://clickhouse.com/docs/ru/interfaces/third-party/client-libraries

Но если ты зациклен на ORM, то придётся использовать только те СУБД, для которых в Django ORM существуют драйверы.

P.S. ClickHouse не для back-end сайта, а для аналитики работы сайта. OLAP, а не типовая реляционная OLTP.