Могу ли я оплатить проезд тройкой автобус из Москвы в Звенигород (Мострансавто)

нет, конечно же.

Обычно Тройкой платят на проезд в городских автобусах, а не в междугородних.
Можете спросить, но я думаю, что вам откажут.

Разумеется, можете.
Карту нужно будет прикладывать дважды - при входе и выходе, чтоб терминал снял правильную сумму.

Да

Надо было на пятёрки учиться, чтобы такие вопросы не задавать. Тройками по математике ты ничего не оплатишь