Применяется ли НДС продуктам, производным внутри страны, или он только для импортных?

Да
НДС это налог

На продукты существуют разные ставки НДС
Например, сахар 20%, хлеб 10%, продукция собственного производства сельхозников не облагается (с.149 НК РФ)