Как делают игровые движки через языки программирования?

Генерация 3D - это математика. И ничего, кроме математики, там нет.
Проекция 3-мерного объекта на 2-мерную плоскость экрана. В докомпьютерную эпоху это в школе проходили - начиная с черчения и заканчивая тригонометрией.

В языках программирования есть всё необходимое для создания движка с нуля, но на гораздо более низком уровне, чем использование кода из готовых библиотек