Почему употребляют Илюше, а не Ильюше, он же Илья, а не Илья?

Употребляют «Илюше», а не «Ильюше», по следующим причинам:

В исходном имени «Илья» присутствует лишь одна буква «л». Соответственно, при образовании уменьшительной формы эта буква не удваивается и не добавляется «ь».
В русском языке существуют правила образования уменьшительно-ласкательных форм. Суффикс «-уш-» присоединяется к основе «Ил-», образуя «Илюша». Здесь нет места для мягкого знака.
Строгих правил образования уменьшительных имён нет. В семейном обиходе возможны и другие уменьшительные формы имени, в том числе «Ильюша»

Илья, а не Илья... Круто

Так сложилось. Ктому же звучит лучше