Лучше всего пересчитать все ролики в один формат. Причём в хорошей профессиональной программе, грамотно работающей с полями. Например, Adobe AfterEffects. Изначально нужно указывать наличие полей в исходнике, если они есть. Тогда при конечном пересчёте поля будут учтены и грамотно обработаны. В данном наборе лучше использовать на выходе 25 fps. При работе с частотой менее 25, использовать "пулдаун", для правильного заполнения. Выходной формат выбрать из наборов предустановок с пометкой "DVD", чтобы при сборке клипы не пересчитывались повторно.

Если выходное качество видео не столь важно, то в любом "дивидимакере" можно слепить, указав "убрать поля" (обычно kill fields)