Написал шейдер на C# в юнити. Но проблема в том что картинка наполовину прозрачна.

Попробуй через void envelope

Ну так вопросы к твоему шейдеру и вообще к тому, что он делает. Если картинка прозрачная, значит ей добавлен альфа-канал. То есть четвёртое значение цвета < 255.