Что делать, если один проект в джаве ссылается на другой?

Конечно не собирается, для этого нужен огромный опыт и мозги
Даже многолетнеопытные разрабы такой херней не занимаются - дизявить и компилить код

По идее, если необходимые библиотеки предоставляются в составе игры, то они вам понадобятся только при компиляции. Если бы вам удалось оформить декомпилированный код в виде проекта Maven и подключить туда необходимые зависимости с пометкой provided, найдя их в репозитории Maven, то Maven смог бы всё это собрать в JAR. Но я не уверен, что зависимости имеются в репозитории.

Другой вариант — найти все необходимые библиотеки в самой игре и подложить их в папку проекта, а затем добавить их в настройки проекта как зависимости.

Думаю, главное — выяснить, чего же конкретно вам не хватает и где оно лежит.

ты по паре слов пытаешься книгу восстановить?
никакая декомпиляция не восстанавливает все использованные библиотеки...