Почему некоторые читатели оправдывают Клода Фролло?

Потому что Фролло изначально не самый плохой человек.

Тянулся к знаниям. Причём уже в 16 лет «мог помериться в теологии мистической — с любым отцом церкви, в теологии канонической — с любым из членов Собора, а в теологии схоластической — с доктором Сорбонны».
В 19 лет лишился родителей, оставшись с младенцем братом на руках. И ничего: вырастил. Если неладно получилось - то уж как умел.
Квазимодо опять же вырастил. Другие такого уродливого младенца растить что-то не собирались.
В бога, которому служил, верил искренне, а не просто прикрывал рясой задницу.

Проблема в том, что Фролло встретил любовь, которая его и сломала. Не надо было воспринимать её как дьявольское искушение. И бороться с его носительницей.

"Клод! Ты летел навстречу науке, свету, солнцу, ты стремился только к
простору, к яркому свету вечной истины; но, бросившись к сверкающему оконцу,
выходящему в иной, мир, в мир света, разума и науки, ты, слепая мушка,
безумный ученый, ты не заметил тонкой паутины, протянутой роком между светом
и тобой, ты бросился в нее стремглав, несчастный глупец! И вот ныне, с
проломленной головой и оторванными крыльями, ты бьешься в железных лапах
судьбы!"