В какой папке Mozila, сохраняются файлы с закладками

там такая фишка импорт, экспорт закладок, сам сохраняешь куда хочешь

Для Моциллы воспользуйся дополнением Foxmarks. Твои закладки разместятся на сервере и будут всегда и везде для тебя доступны. https://addons.mozilla.org/ru/firefox/search?q=Foxmarks&cat=all
И будут всегда синхронизированы.

сделай проще
закладки----управление закладками----импорт и резервирование
и вот шастье ты делаешь бекап закладок)

в папке с профилем. bookmarks.html поищи в c:\dokuments and settings\tvoj_user\application data

C:\Documents and Settings\Admin\Application Data\Mozilla