Это удобнее для обработки сложных изображений.
Например, взять картинку из гугла:
Ну и допустим мы её рисуем "с нуля". Нам надо минимум три (четыре) основных слоя:
1. Дерево.
2. Почва.
2.* Камни
3. Небо.
Можно ещё иногда добавлять слои-корректоры для каждого из них. А ведь это простенькая картинка.
Потом, допустим нам надо использовать общий фон для набора картинок - создаём слой и на него сверху лепим второй с нужной картинкой/текстом. Потом берём следующую картинку/текст и заменяем предыдущий. Если фон делался вручную, то будете молиться на слои.
Это очень примитивное объяснение назначения слоёв. Их можно применять как угодно даже в интерактивном режиме: навесили слой с картинкой, поиграли прозрачностью, коррекцией - не понравилось. . Заменили слой и всё ок. Натыкали слои с тектом и картинками - посмотрели что убрать (погасили слой) , а что выделить, переместить вперёд/назад (порядок слоёв) и выбрали нужное сочетание. Анимацию в конце концов тоже можно послойно делать. Применений уйма.