Подскажите, лилия заболела наверное это ботритис - цветки наполовину деформированные и листья частично почернели

Выкидывать лилию не надо, выкапывайте и обрабатывайте препаратом с медью. В этот же день посадите, только в другое место. При этом треть или половину стебля сохраняйте, а уже осенью, когда стебель пожелтеет, можно будет его обрезать.
В принципе можно и не выкапывать, а пролить почву и обработать стебель опрыскиванием опять же медьсодержащим препаратом.